Le gouvernement accordait en juillet 2017 une enveloppe de 400 M€ sur cinq ans au plan France médecine génomique 2025. Coordonné par Aviesan, il vise à démocratiser la médecine génomique et promet à terme de séquencer par an le génome de 20 000 patients atteints de maladies rares. Deux plateformes ont ainsi vu le jour et sont désormais fonctionnelles tant sur la partie séquençage que la partie traitement informatique. Le projet est-il en phase avec les espérances? mind Health a interrogé le directeur d'Aviesan et des responsables des deux plateformes, ainsi qu'un partenaire industriel. "Nous nous étions fixé un objectif de 1 000 patients atteints de maladies rares et de 1 000 patients atteints de cancer dont nous allions séquencer le génome en 2019. Nous en sommes bien loin, déplore Amaury Martin, administrateur du groupement de coopération sanitaire (GCS) SeqOIA qui porte la plateforme de séquençage en Île-de-France. Fin septembre 2019, ce chiffre s'élevait à quatre trios de patients atteints de maladie rare (un trio étant constitué des parents et de l'enfant, ndlr) et 12 séquençages de cancers pédiatriques. "
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Mettre en place une filière nationale de médecine génomique au service des patients, capable d'être un levier d'innovation scientifique et technologique, de valorisation industrielle et de croissance économique. Placer la France dans le peloton de tête des grands pays engagés dans la médecine personnalisée, avec une capacité d'exportation du savoir-faire de notre filière médicale et industrielle en médecine génomique
LES PRÉINDICATIONS ET LEUR MISE EN PLACE
Les laboratoires de biologie médicale
Aujourd'hui, deux laboratoires de séquençage génomique à très haut débit sont opérationnels: SeqOIA (en Ile-de-France) et AURAGEN (en Auvergne-Rhône-Alpes). Ils couvrent l'ensemble des besoins du territoire national. Ils sont chargés d'assurer les étapes pré-analytiques (réception des prélèvements et qualification, extraction des acides nucléiques, gestion des non-conformités), analytiques (analyses génomiques et traitement bio-informatique), et post analytiques (interprétation médicale). La répartition de la prise en charge des analyses sur SeqOIA ou AURAGEN se fait en fonction de la localisation du prescripteur.
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Du côté d'Auragen, la plateforme de séquençage en Auvergne-Rhône-Alpes, les génomes de sept trios seulement ont été séquencés, précise Jean-Yves Blay, son directeur scientifique et directeur du centre Léon Bérard. Un retard par rapport aux ambitions de 2017 puisque chacune des deux plateformes a pour mission de produire 18 000 séquences génomiques par an d'ici 2025. Démocratiser la médecine génomique "L'intérêt du plan est de faire en sorte que la médecine génomique devienne une réalité en France, souligne Franck Lethimonnier, directeur de l'institut thématique de l'Inserm Technologies pour la santé et directeur d'Aviesan chargé du pilotage de la coordination du plan. Pour les patients atteints d'une maladie rare et en errance diagnostique (seulement un quart d'entre eux est diagnostiqué aujourd'hui par la médecine classique), l'idée est d'utiliser l'information obtenue grâce au séquençage complet du génome pour poser un diagnostic. Préciser l'origine génétique de la pathologie permettra aussi d'identifier des approches thérapeutiques nouvelles.
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Un troisième comité, le comité de suivi associe aux pilotes opérationnels des actions, les institutions et tutelles impliquées en vue de planifier et de s'assurer du bon déroulement des actions du plan, d'en apprécier les résultats ou encore de suivre l'évolution de la dépense par rapport au budget prévu. A terme, le plan prévoit de:
déployer dans les 4 ans à venir un réseau de douze plateformes de séquençage couvrant l'ensemble du territoire,
mettre en place les outils pour exploiter les volumes de données générées avec l'installation d'un Collecteur analyseur de données (CAD), capable de traiter et d'exploiter le volume considérable de données générées en les appariant avec les données médicales et d'offrir les premiers services dans le cadre du parcours de soin. d'anticiper les évolutions technologiques et leurs transpositions dans les plateformes et le CAD par la mise en place d'un Centre de référence, d'innovation, et d'expertise (CRefIX) et en favorisant la création d'une filière industrielle française très compétitive.
Plan France Médecine Génomique 2005 Relatif
Enfin, conscientes des enjeux que représente la médecine génomique, les associations de malades en lien avec l'Inserm se sont particulièrement impliquées, comme en témoigne leur contribution à l'élaboration de ce Plan. La médecine génomique, une compétition internationale et des enjeux majeurs
Les États-Unis, le Royaume Uni et la Chine ont lancé des plans nationaux ambitieux au cours des deux dernières années, visant à la fois à développer une stratégie nationale et à soutenir leurs acteurs industriels. Avec eux, de nombreux acteurs industriels se mobilisent pour déployer des solutions technologiques dédiées à la médecine génomique et à la gestion des données numériques massives associées. De grandes entreprises internationales ont perçu le fort potentiel de développement de cette santé numérique et investissent ce secteur. En Europe, plusieurs pays ont commencé à intégrer la médecine génomique dans leur système de santé: Estonie, Pays-Bas, Slovénie. Le risque de voir se développer un tourisme médical vers des pays du Continent offrant ce type de service existe avec lui celui d'une aggravation des inégalités de santé.
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Ces deux plateformes, SeqOIA en Ile-de-France, et AURAGEN en région Auvergne-Rhône-Alpes, sont désormais opérationnelles et ont séquencé leurs premiers génomes. Dans la phase de démarrage de l'activité, chaque plateforme devrait avoir une capacité de l'ordre de 1000 séquençages par an. Le groupe de travail du PFMG 2025 coordonné par la Haute Autorité de Santé (HAS) avait sélectionné 12 des 69 propositions des Filières de Santé Maladies Rares lors d'une première vague en janvier 2019. En ce début d'année 2020, le groupe de travail en a sélectionné 51 autres, dont une pour Filfoie: Pathologies sévères du foie à révélation pédiatrique. Cette pré-indication a été portée par le Pr Emmanuel Gonzales (clinicien) et le Dr Anne Spraul (biologiste). > Lire l'interview du Dr Anne Spraul sur le PFMG 2025 pour notre Bulletin de Recherche
La pré-indication Filfoie
Toutes les informations sur les critères de soumission d'un dossier en RCP génomique ainsi que le détail de la stratégie diagnostique sont disponibles sur le site du PFMG.
Les trois premières pathologies auxquelles le rapport suggère d'appliquer ce dispositif sont le cancer, le diabète et les maladies rares, avant de l'étendre à la prise en charge de maladies communes à partir de 2020. Le plan intègre les dimensions éthiques liées à ces nouvelles pratiques. Toutes les garanties seront bien sûr apportées quant à la protection des patients et des données les concernant. Le Gouvernement souscrit aux conclusions de ce rapport et consacrera les moyens nécessaires à sa réussite. Le plan représente un investissement total de 670 millions d'euros pour les 5 premières années de son développement, avec un apport d'entreprises d'environ 230 millions d'euros, dans le cadre de partenariats. L'État mobilisera notamment le budget de la sécurité sociale pour la mise en place des plateformes de séquençage, dès 2017. Le Programme d'Investissements d'Avenir (PIA) sera sollicité pour participer au financement des deux centres nationaux. L'infrastructure France Génomique d'Evry, coordonnée par le Commissariat à l'Énergie atomique et aux Energies alternatives (CEA), apportera son soutien au projet.
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La ville insiste sur le fait que malgré ces travaux, les commerces de la rue de France resteront ouverts le long de l'artère concernée.
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Voici un an jour pour jour, un important chantier d'égouttage débutait dans la rue de France pour le compte de l'intercommunale Ipalle. Etalés sur un mois, les travaux de l'époque réalisés le long de cette voirie débouchant sur la Grand-Place s'étaient traduits par la pose d'un collecteur et d'une conduite d'égout. Douze mois plus tard, des travaux de réparation s'avèrent nécessaires au niveau d'un raccordement d'égoût. L'intercommunale de propreté publique de Wallonie Picarde a de nouveau fait appel a l'entreprise TRBA pour exécuter ces travaux planifiés à partir de ce mardi 9 mars jusqu'au vendredi 19 mars inclus. Ain que les ouvriers puissent travailler dans les meilleures conditions possibles, il ne sera pas possible pour les automobilistes de circuler ni de stationner dans cette voirie avant la fin du chantier, excepté en dehors des conditions particulières pour les riverains qui ont reçu un courrier à ce sujet dans leur boîte aux lettres. Durant la durée du chantier, la circulation sera déviée via le boulevard du Château, la "trémie" - rue du Grand Pont, la place des Combattants, la rue Léon Trulin, la rue de Pintamont, la rue aux Gâdes et la Grand'Place.
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