Résumé du document Le SDS-PAGE (Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide) est une technique de gel d'électrophorèse. Cette technique consiste à faire migrer des protéines dans un gel, grâce à un courant électrique, afin de les séparer en fonction de leur masse moléculaire. Lors d'un précédent TP, la sérumalbumine bovine (SAB, Mr= 66, 0kDa) et le cytochrome c (12, 4kDa) ont été séparés par chromatographie d'exclusion sur gel de Séphadex, en fonction de leur taille. Sommaire Matériels et méthodes Préparation des gels Préparation des échantillons Mise en place de la migration Coloration des protéines Résultats et interprétation Extraits [... Compte-rendu de Biochimie - Gel d'electrophorèse SDS-PAGE (L2). ] C'est un indicateur de pH qui devient bleu en milieu basique. De plus, le fond de migration est marqué. Les protéines migrant au-dessus de ce fond de migration, il devient plus simple de stopper le courant au bon moment, stoppant ainsi la migration. D. Mise en place de la migration. Le gel polymérisé est alors formé de deux gels différents. Ce dernier, coincé entre deux plaques, est transféré dans la cuve à électrophorèse.
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On obtient des teneurs en protéine de fractions recueillies de et 77% cela signifie que la séparation entre les deux protéines n'est pas complète. Cela, peut-être dû à la qualité du gel ou à des erreurs de mesures. Calaméo - Filtration sur gel, méthode de Penefsky. Le rendement étant de 61 on peut dire que nous avons une perte de 39% des protéines que nous avions au départ. Malgré de possibles erreurs de manipulation, on peut penser que le gel utilisé ici n'est pas optimale quant à la séparation de SAB et de Cytochrome c. Conclusion: lors de la séparation de deux protéines différente dans un élange via une chromatographie d'exclusion sur gel de Sephadex. On obseNe, au vu de notre faible rendement que ce gel ne semble pas être bien adapté pour les protéines que nous avons utilisé (SAB et cytochrome c). Afin d'améliorer la résolution de séparation de différentes protéines par chromatographie d'exclusion sur gel il faudrait adapter le domaine de fractionnement de manière plus précise, un domaine de fractionnement plus faible aurait permis que la protéine SAB soit complètement exclue comme le bleu Dextran et on aurait eu des coefficients de partage nuls.
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si 0 < K <1, le soluté est partiellement inclus. Le taux d'inclusion augmente avec K.
si K = 1, valeur théorique correspondant à une inclusion totale d'un composé dans le gel. si K > 1, le soluté est inclus et adsorbé. Tp chromatographie d exclusion sur gel sephadex y. Figure 5: Diagramme d'élution des substances A et B.
Donc, si l'on dépose un mélange de 2 solutés A et B dont les constantes de distribution sont respectivement égales à 0 et 1,
A sera élué avec un volume d'élution V e A = V m
B sera élué avec un volume d'élution V e B = V m + V i
L'expression générale qui relie le volume d'élution d'un soluté à son coefficient de distribution est:
La constante K est égale à: concentration du soluté dans l'eau interne / concentration du soluté dans l'eau externe.
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Le gain d'eau correspond au nombre de grammes d'eau fixés par gramme de substance sêche. Gels permanents: ce sont des copolymères organiques ou bien des minéraux (silice). Chromatographie d'exclusion. Ici, des effets d'adsorption s'ajoutent au tamisage moléculaire. Figure 2: Représentation d'un gel d'exclusion. Représentation des résultats: Soit l'on porte logarithme de la masse moléculaire en fonction du volume d'élution (Figure 2 ci-dessous): log MM = f (V e)
Soit l'on porte logarithme de la masse moléculaire en fonction du KAV, le coefficient de partage entre la phase liquide et la phase gel: log MM = f (K AV). Le K AV, est le coefficient de partage entre la phase liquide et la phase gel:
K AV = (V e - V m) / (V t - V m)
V t = volume total
(il est mesuré en remplissant la colonne d'eau)
V m = volume mort
(il est déterminé en mesurant le V e d'une substance totalement exclue)
Représentation du logarithme de la masse moléculaire en fonction du volume d'élution:
Figure 3: Variation du volume d'élution en fonction de log MM.
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[1] La SEC est une méthode de caractérisation des polymères largement utilisée en raison de sa capacité à fournir de bons résultats de distribution de masse molaire (Mw) pour les polymères. La principale application de la chromatographie par filtration sur gel est le fractionnement des protéines et d'autres polymères solubles dans l'eau, tandis que la chromatographie par perméation sur gel est utilisée pour analyser la distribution du poids moléculaire des polymères organiques solubles. L'une ou l'autre technique ne doit pas être confondue avec l'électrophorèse sur gel, où un champ électrique est utilisé pour "tirer" ou "pousser" les molécules à travers le gel en fonction de leurs charges électriques. La durée pendant laquelle un soluté reste dans un pore dépend de la taille du pore. Les solutés plus grands auront accès à un volume plus petit et vice versa. Tp chromatographie d exclusion sur gel sephadex de. Par conséquent, un soluté plus petit restera dans le pore pendant une plus longue période de temps par rapport à un soluté plus grand.
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L'une de nos protéines à séparer est la SAB (sérumalbumine bovine) de masse moléculaire 66000 DALTON supérieur au domaine de fractionnement qui est compris entre 1500- 30000 DALTON, exclue du gel elle sera donc éluée en premier. Tp chromatographie d exclusion sur gel sephadex et. La seconde protéine à séparer est le cytochrome c de masse moléculaire 12400 dalton est compris dans le domaine de fractionnement, il peut pénétrer plus ou moins profondément dans les pores et ce sera donc la seconde fraction éluée. Étant donné que les protéines ont un maximum d'absorbance à 280 nm dû aux aminoacides aromatiques et que le cytochrome c de couleur rouge est visible à 409 nm, on peut déterminer par spectrophotométrie la concentration de
Carte de sejour
1833 mots | 8 pages
RAPPORT DE STAGE
Mon projet de reconversion professionnelle initiée à l'ARPEIJE avec Mme Rachel ADIL il y a quatre mois environ a forcé mon choix pour la gestion paie. Le cabinet Fiduciaire Monsigny a accepté ma demande de faire un stage au sein du cabinet dans le service gestion paie.
Les plus petites molécules (en vert) pénètrent plus profondément dans les pores. Les solutés sont donc élués dans l'ordre des masses molaires décroissantes. Le matériel est identique à celui de l' HPLC classique. Les détecteurs les plus appropriés sont ceux à barette de diode et ceux à réfractomètre. Les détecteurs UV peuvent également être employés avec le risque que certaines molécules ne soient pas détectées en raison de leur absence de chromophore. La colonne doit être choisie en fonction de la taille des pores et des molécules à analyser. Pour les protéines, on choisit généralement des pores de 300 Armstrong
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